El entrenamiento EMS puede ser perjudicial en caso de contraindicaciones de salud (ver pregunta anterior), como marcapasos o diabetes mellitus. En estos casos, se debe evitar el entrenamiento. Asimismo, un entrenamiento con una intensidad o frecuencia demasiado alta puede ser peligroso. Sin embargo, si se utiliza correctamente y se siguen las instrucciones de entrenamiento de eaglefit, el entrenamiento EMS es seguro y logra efectos máximos de entrenamiento.